Yeni Malatyaspor, 2022-2023 sezonunda yaşanan 6 Şubat depremler nedeniyle ligi tamamlayamamış, ardından 2023-2024 sezonunda Malatya'nın içinde bulunduğu koşullar sebebiyle ligde yer alamamıştı.
Süper Lig'den düştükten sonra 1. Lig'de zorlu günler geçiren Yeni Malatyaspor'un 2024-2025 sezonunda hangi ligde mücadele edeceği merak konusu oldu.
Yeni Malatyaspor, Kahramanmaraş merkezli depremler yaşandığında 1. Lig'de yer alıyordu. Sarı-siyahlı takım, 2022-2023 sezonunda deprem sebebiyle sezonu tamamlayamadı ve kalan maçlarda hükmen 3-0 mağlup sayıldı.
Bu sezonu yarıda bırakan Yeni Malatyaspor, yaşanan deprem nedeniyle küme düşmedi ve dolayısıyla 1. Lig'de kaldı.
Sarı-siyahlı takımın yönetimi, kentin içinde bulunduğu durum ve şartların futbol oynamaya uygun olmaması sebebiyle 2023-2024 sezonunda ligde mücadele etmemek için Türkiye Futbol Federasyonu'na başvuruda bulundu. TFF, "hakları saklı kalmak" kaydıyla Yeni Malatyaspor'un başvurusuna olumlu cevap verdi.
Yaklaşık 1,5 sezon boyunca 1. Lig'de mücadele etmeyen Yeni Malatyaspor, yeni sezonda kaldığı yerden yani 1. Lig'den yoluna devam edecek.